1525

Aufständische Bauern plündern und zerstören zahlreiches Inventar, darunter Kleinodien, Bücher und Archivalien. Nach der im Harzbereich sich durchsetzenden Reformation verliert das Kloster allmählich seine eigentliche Funktion.

 

1547

Graf Wolfgang zu Stolberg richtet in den Klausurgebäuden eine evangelische Klosterschule ein, die bis 1626 besteht.

 

1572

Graf Christoph zu Stolberg wird Administrator des Klosters.

 

1573

Wegen Baufälligkeit veranlasst Christoph zu Stolberg den Rückbau der Klosterkirche.

1609

Graf Heinrich zu Stolberg beginnt mit dem Ausbau der an der Westseite des Klostergeländes gelegenen Gebäude zu einem herrschaftlichen Wohnsitz, den von 1615 bis 1625 seine Witwe Adriane, geb. von Mansfeld, bewohnt.

 

1648

Heinrich Ernst, Begründer der alten wernigerödischen Linie des Hauses Stolberg, wählt Ilsenburg zu seinem Hauptwohnsitz. Im Zusammenhang mit der gräflichen Hofhaltung entsteht die barocke Innenausstattung der einstigen Klosterkirche.

 

1687

Kurfürst Friedrich Wilhelm von Brandenburg erkennt Kloster Ilsenburg als Eigentum der Stolberger Grafen an.

 

1716

Graf Christian Ernst zu Stolberg-Wernigerode verlegt den Regierungssitz seiner Grafschaft nach Wernigerode. Die Klausurgebäude werden in den Folgejahren wirtschaftlich genutzt. In den Schlossflügel ziehen gräfliche Beamte ein.

 

1861-1863

Graf Otto zu Stolberg-Wernigerode lässt den Barockbau oberhalb der Ilse nach Plänen des Herzoglichen Braunschweigischen Eisenbahnmeisters Carl Ebeling im Stil der Neoromanik umbauen. Leitender Architekt ist Carl Frühling aus Blankenburg. Bis 1929 bewohnen Mitglieder der fürstlichen Familie Schloss Ilsenburg.

 

1929

Verpachtung von Schloss, ehemaligen Klausurgebäuden und Schlosspark an die Altpreußische Union der Evangelischen Kirchen Berlin. In den nächsten 30 Jahre werden hier verschiedenen Fortbildungseinrichtungen etabliert.